MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosarcina acetivorans C2A chromosome

Total Repeats: 112404

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_003552	TA	3	6	23987	23992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_003552	AACA	2	8	24031	24038	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
503	NC_003552	TG	3	6	24096	24101	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
504	NC_003552	TGA	2	6	24112	24117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_003552	GATTA	2	10	24121	24130	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
506	NC_003552	ATTT	2	8	24140	24147	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_003552	ATG	2	6	24213	24218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_003552	AGG	2	6	24231	24236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
509	NC_003552	CATA	2	8	24246	24253	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
510	NC_003552	TAA	2	6	24273	24278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_003552	TAT	2	6	24288	24293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_003552	AT	4	8	24305	24312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_003552	TTTTC	2	10	24382	24391	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
514	NC_003552	ACTA	2	8	24479	24486	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
515	NC_003552	AAT	2	6	24518	24523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_003552	CAC	2	6	24547	24552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
517	NC_003552	A	6	6	24560	24565	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_003552	ATT	2	6	24574	24579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_003552	AAG	2	6	24598	24603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_003552	TGA	2	6	24911	24916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20088916
521	NC_003552	TGA	2	6	24984	24989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20088916
522	NC_003552	AAT	3	9	25061	25069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	20088916
523	NC_003552	AGA	3	9	25090	25098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_003552	TTC	2	6	25169	25174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_003552	GAA	2	6	25280	25285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088917
526	NC_003552	GTT	2	6	25428	25433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20088917
527	NC_003552	AAT	2	6	25577	25582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	20088917
528	NC_003552	CCTG	2	8	25586	25593	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
529	NC_003552	AAT	2	6	25608	25613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_003552	TAT	2	6	25689	25694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_003552	AAG	2	6	25715	25720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_003552	AAG	2	6	25887	25892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088918
533	NC_003552	T	6	6	25977	25982	0 %	100 %	0 %	0 %	20088918
534	NC_003552	GAA	2	6	26021	26026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088918
535	NC_003552	TAT	2	6	26099	26104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20088918
536	NC_003552	AGA	2	6	26126	26131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088918
537	NC_003552	CA	3	6	26159	26164	50 %	0 %	0 %	50 %	20088918
538	NC_003552	GGC	2	6	26165	26170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	20088918
539	NC_003552	GGAT	2	8	26221	26228	25 %	25 %	50 %	0 %	20088918
540	NC_003552	GAT	2	6	26372	26377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20088918
541	NC_003552	GGA	2	6	26387	26392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20088918
542	NC_003552	A	6	6	26427	26432	100 %	0 %	0 %	0 %	20088918
543	NC_003552	AG	3	6	26684	26689	50 %	0 %	50 %	0 %	20088918
544	NC_003552	GAA	3	9	26700	26708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088918
545	NC_003552	GAA	2	6	26736	26741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088918
546	NC_003552	AGAA	2	8	26767	26774	75 %	0 %	25 %	0 %	20088918
547	NC_003552	AAATC	2	10	26804	26813	60 %	20 %	0 %	20 %	20088918
548	NC_003552	TTTC	2	8	26826	26833	0 %	75 %	0 %	25 %	20088918
549	NC_003552	CTC	2	6	26954	26959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20088918
550	NC_003552	AAG	2	6	26960	26965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088918
551	NC_003552	GGA	2	6	27068	27073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20088918
552	NC_003552	TCTTCC	2	12	27078	27089	0 %	50 %	0 %	50 %	20088918
553	NC_003552	GAA	2	6	27090	27095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088918
554	NC_003552	TTG	2	6	27172	27177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20088918
555	NC_003552	ATGCA	2	10	27187	27196	40 %	20 %	20 %	20 %	20088918
556	NC_003552	ATA	2	6	27229	27234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	20088918
557	NC_003552	TGAA	2	8	27265	27272	50 %	25 %	25 %	0 %	20088918
558	NC_003552	TTC	2	6	27332	27337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088918
559	NC_003552	GTT	2	6	27354	27359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20088918
560	NC_003552	CAG	2	6	27384	27389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20088918
561	NC_003552	CAGAC	2	10	27424	27433	40 %	0 %	20 %	40 %	20088918
562	NC_003552	TGT	2	6	27500	27505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20088918
563	NC_003552	TGAT	2	8	27568	27575	25 %	50 %	25 %	0 %	20088918
564	NC_003552	GAA	2	6	27635	27640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088918
565	NC_003552	GCT	2	6	27732	27737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20088918
566	NC_003552	GAA	2	6	27762	27767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088918
567	NC_003552	AT	3	6	27787	27792	50 %	50 %	0 %	0 %	20088918
568	NC_003552	GAA	2	6	27846	27851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088918
569	NC_003552	CT	3	6	27894	27899	0 %	50 %	0 %	50 %	20088918
570	NC_003552	A	6	6	27918	27923	100 %	0 %	0 %	0 %	20088918
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574	NC_003552	GAG	2	6	28179	28184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20088919
575	NC_003552	GTA	2	6	28299	28304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20088919
576	NC_003552	GAAA	2	8	28337	28344	75 %	0 %	25 %	0 %	20088919
577	NC_003552	TCT	2	6	28440	28445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088919
578	NC_003552	CTT	2	6	28524	28529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088919
579	NC_003552	CTG	2	6	28533	28538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20088919
580	NC_003552	CAGC	2	8	28580	28587	25 %	0 %	25 %	50 %	20088919
581	NC_003552	TCT	3	9	28590	28598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088919
582	NC_003552	CTT	2	6	28609	28614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088919
583	NC_003552	AGC	2	6	28618	28623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20088919
584	NC_003552	GAG	2	6	28629	28634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20088919
585	NC_003552	AT	3	6	28673	28678	50 %	50 %	0 %	0 %	20088920
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591	NC_003552	T	6	6	28990	28995	0 %	100 %	0 %	0 %	20088920
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602	NC_003552	TCTT	2	8	29527	29534	0 %	75 %	0 %	25 %	20088920
603	NC_003552	T	6	6	29641	29646	0 %	100 %	0 %	0 %	20088920
604	NC_003552	GTG	2	6	29707	29712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	20088920
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609	NC_003552	T	7	7	30158	30164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_003552	CTT	2	6	30172	30177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_003552	TAC	2	6	30187	30192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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613	NC_003552	T	6	6	30238	30243	0 %	100 %	0 %	0 %	20088921
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615	NC_003552	CT	3	6	30295	30300	0 %	50 %	0 %	50 %	20088921
616	NC_003552	A	8	8	30335	30342	100 %	0 %	0 %	0 %	20088921
617	NC_003552	TCC	2	6	30367	30372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20088921
618	NC_003552	CAA	3	9	30392	30400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	20088921
619	NC_003552	GCA	2	6	30421	30426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20088921
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626	NC_003552	AT	3	6	30939	30944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_003552	CTTA	2	8	30972	30979	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
628	NC_003552	TGAAA	2	10	31005	31014	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
629	NC_003552	A	6	6	31046	31051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_003552	TTG	2	6	31102	31107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20088922
631	NC_003552	GGA	2	6	31254	31259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20088922
632	NC_003552	TGT	2	6	31274	31279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20088922
633	NC_003552	TTC	2	6	31445	31450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088922
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